Mesmo de saída do Ministério da Transparência, Fabiano Silveira será alvo de investigação por parte do Conselho Nacional de Justiça (CNJ). Segundo informações da coluna Painel, do jornal Folha de S. Paulo, o procedimento prévio quer apurar se ele usou o cargo de conselheiro do órgão para favorecer interesses privados. A investigação tem base nas conversas gravadas pelo ex-presidente da Transpetro, Sérgio Machado, nas quais ele orienta o presidente do Senado, Renan Calheiros, em relação à Lava Jato. A corregedora Nancy Andrighi viu indícios de crime nos diálogos e deve pedir ao plenário a abertura de processo. Silveira foi conselheiro do órgão entre 2013 e 2016, por indicação do Senado, e fica exposto às mesmas punições recebidas por magistrados no exercício de suas funções. Michel Temer ainda tentou fazer com que Silveira ficasse, no telefonema da demissão. O ex-ministro, no entanto, ficou inseguro ao ver integrantes do governo utilizarem a expressão ”por enquanto” para se referirem à sua permanência no cargo.
